Dieses Kapitel steht für sich allein und unterscheidet sich in Art und Ziel von den folgenden. Es richtet sich besonders an Lesende, die sich für die praktischen Aspekte von Simulationen der Molekulardynamik (MD) interessieren und die sich anhand eines ausgewählten Beispiels einen Eindruck von den Möglichkeiten dieser Technik verschaffen wollen.