Das Mikrobiom wird in seiner Entwicklung nach der Geburt dargestellt. Auf die Bedeutung für die Versorgung mit Energieträgern und Mikronährstoffen wird ebenso eingegangen wie auf die Einflüsse auf das Immunsystem. Obwohl das Mikrobiom für die funktionelle Kapazität des Darms beim Kurzdarmsyndrom vermutlich von großer Bedeutung ist, gibt es bisher nur wenig wissenschaftliche Daten.