Bei Höhenaufenthalten ist viel Erfahrung für die pulsoxymetrische Messung selbst sowie für die Interpretation der Messwerte erforderlich, denn sie ist in der Höhe erheblich komplexer als in Meereshöhe. Wegen der periodischen Atmung muss über einen längeren Zeitraum gemessen und dabei der repräsentative Wert des Messintervalls bestimmt werden. Hinzu kommt die zirkadiane Rhythmik der Sauerstoffsättigung, weshalb Messungen immer zum gleichen Zeitpunkt, z. B. morgens, erfolgen sollten. Auch muss zwingend auf Hyperventilation geachtet werden, da diese das Ergebnis sonst erheblich beeinflusst. Schlaf- und Belastungsmessungen ergeben wertvolle zusätzliche Informationen, sind aber mit noch mehr Aufwand verbunden.