Da auch der raffinierteste Mikrocontroller der Welt nur ausführt, was ihm zuvor aufgetragen worden ist, muss man ihm mitteilen, was er abarbeiten soll. Dies geschieht, indem man eine Folge von Befehlen eingibt, die als „Programm“ bezeichnet werden. Das Ergebnis des Programmierens wird als „Software“ bezeichnet, im Gegensatz zur „Hardware“, womit integrierte Schaltkreise in digitaler, analoger und hybrider (analog/digital) Schaltkreise, Platine und Gerätebestandteile des Mikrocontrollers definiert sind.